Aumento na acurácia da DEP de tourinhos de reposição

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Aumento na acurácia da DEP de tourinhos de reposição com o uso de marcadores genéticos

A existência de painéis de comerciais de marcadores genéticos no mercado brasileiro e a necessidade de avaliar o impacto da inclusão dessa informação em um programa de avaliação genética motivaram o desenvolvimento do estudo realizado na Faculdade de Zootecnia e Engenharia de Alimentos da USP, em Pirassununga-SP, sob a orientação dos Profs. Drs. Flávio Vieira Meirelles e José Bento Sterman Ferraz, que deu origem à tese de doutorado da aluna Fernanda Marcondes de Rezende, atualmente professora da Universidade Federal de Uberlândia, no campus avançado de Patos de Minas.

Dados de 84.404 animais com mensurações para ganho de peso pós desmama (GPD), circunferência escrotal (CE) e escore de musculosidade (EM) aos 18 meses, correspondentes a 116.652 animais na matriz de parentesco, dos quais 3.160 foram genotipados para 106 marcadores do tipo SNP (polimorfismo de único nucleotídeo) foram analisados.

A primeira suposição avaliada nesse estudo foi o impacto na qualidade de ajuste e na habilidade preditiva de modelos estatísticos de predição do valor genético pela inclusão de dados moleculares, utilizando apenas os dados dos animais genotipados. Os resultados dessa análise demonstraram que a inclusão dos efeitos dos marcadores juntamente com os efeitos poligênicos (efeito genético aditivo direto advindo das relações de parentesco entre os animais considerado no modelo por meio da inclusão da matriz de parentesco) melhorou a qualidade de ajuste dos modelos para todas as características avaliadas, mas apresentou habilidade de predição do valor genético equivalente à observada com a aplicação do modelo clássico de avaliação genética, que considera apenas os efeitos poligênicos.

No passo seguinte, foram avaliadas as alterações na acurácia das estimativas de valor genético dos animais pela inclusão dos efeitos dos marcadores no modelo de avaliação genética clássica. Para tanto, todos os dados disponíveis, de animais genotipados ou não, foram analisados conjuntamente, por meio de análises bicaracterísticas entre os fenótipos mensurados e os respectivos valores genéticos moleculares, obtidos pela soma dos efeitos de substituição dos marcadores ponderados pelo número de alelos favoráveis (0, 1 ou 2) presentes em cada locus. Essas alterações foram avaliadas dentro de categorias de animais definidas por sua importância dentro do rebanho, dado o potencial para transmitir seus alelos para as gerações futuras. As categorias consideradas foram:

  • Geral: todos os animais que compuseram a matriz de parentesco;
  • Touro: pai de animais que apresentaram medições em qualquer uma das características analisadas;
  • CEIP: animais jovens que receberam o certificado CEIP ou que estavam aptos a receber e foram aprovados em avaliação visual, considerados como tourinhos de reposição para o programa.

As categorias Touro e CEIP foram subdivididas em animais não genotipados (_ng) e genotipados (_g), totalizando cinco categorias analisadas.

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Adicionalmente, foram avaliados os possíveis conflitos de seleção ao serem selecionados os animais top 20% com base no valor genético estimado pela avaliação genética clássica (VG) e o estimado pela avaliação genética assistida por marcadores (VGAM).Indicados os pontos de truncamento para a seleção dos 20% melhores animais em cada critério de classificação com base em todo rebanho analisado, a exemplo do que é permitido para os programas autorizados pelo MAPA (Ministério da Agricultura, Pecuária e Abastecimento) a emitir CEIP (Certificado Especial de Identificação e Produção).

 

Fonte:BeefPoint, escrito por Fernanda Marcondes de Rezende (UFU), José Bento Sterman Ferraz (FZEA-USP), Noelia Ibáñez-Escriche (IRTA), Flávio Vieira Meirelles (FZEA/USP)*.


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